À partir de 1602, Henri IV doit faire face à un mécontentement nobiliaire qui se cristallise autour de plusieurs grandes affaires comme le complot du duc de Biron et la conspiration de la famille d’Entragues. Les années 1602-1606 sont également marquées par la rébellion du maréchal protestant Henri de La Tour d’Auvergne, duc de Bouillon. Longtemps considéré comme un « malcontent professionnel », il apparaît toutefois que sa conduite est dictée par divers motifs. En revenant sur son parcours, mais aussi sur ses liens avec le roi, la noblesse du royaume et les princes protestants, il convient d’étudier les enjeux religieux politiques et sociaux de cette querelle.